Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
RABEP1Q15276 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RABEP1Q15276 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RABEP1Q15276 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RABEP1Q15276 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RABEP1Q15276 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RABEP1Q15276 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RABEP1Q15276 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RABEP1Q15276 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RABEP1Q15276 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RABEP1Q15276 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RABEP1Q15276 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RABEP1Q15276 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RABEP1Q15276 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RABEP1Q15276 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RABEP1Q15276 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RABEP1Q15276 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RABEP1Q15276 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RABEP1Q15276 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RABEP1Q15276 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RABEP1Q15276 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RABEP1Q15276 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RABEP1Q15276 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RABEP1Q15276 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RABEP1Q15276 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RABEP1Q15276 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RABEP1Q15276 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
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