Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NKX1-1Q15270 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NKX1-1Q15270 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NKX1-1Q15270 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NKX1-1Q15270 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NKX1-1Q15270 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NKX1-1Q15270 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NKX1-1Q15270 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NKX1-1Q15270 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NKX1-1Q15270 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
NKX1-1Q15270 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
NKX1-1Q15270 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NKX1-1Q15270 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NKX1-1Q15270 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NKX1-1Q15270 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NKX1-1Q15270 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NKX1-1Q15270 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NKX1-1Q15270 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NKX1-1Q15270 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NKX1-1Q15270 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NKX1-1Q15270 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NKX1-1Q15270 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NKX1-1Q15270 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NKX1-1Q15270 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NKX1-1Q15270 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms