Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDK1Q15118 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDK1Q15118 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDK1Q15118 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDK1Q15118 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms