Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LAPTM4AQ15012 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LAPTM4AQ15012 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms