Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPRIN1Q14444 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPRIN1Q14444 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPRIN1Q14444 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
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