Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
CDK13Q14004 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CDK13Q14004 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CDK13Q14004 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CDK13Q14004 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CDK13Q14004 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CDK13Q14004 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CDK13Q14004 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CDK13Q14004 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CDK13Q14004 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CDK13Q14004 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CDK13Q14004 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CDK13Q14004 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CDK13Q14004 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CDK13Q14004 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CDK13Q14004 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CDK13Q14004 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
CDK13Q14004 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
CDK13Q14004 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.76
CDK13Q14004 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CDK13Q14004 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CDK13Q14004 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CDK13Q14004 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CDK13Q14004 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CDK13Q14004 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CDK13Q14004 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CDK13Q14004 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CDK13Q14004 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CDK13Q14004 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CDK13Q14004 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CDK13Q14004 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CDK13Q14004 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CDK13Q14004 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CDK13Q14004 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CDK13Q14004 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
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