Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 APOC1-202ENST00000588750 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.852e-8■■■■■ 46.6
PABPC4Q13310 CA1-219ENST00000523022 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 46.4
PABPC4Q13310 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 46.4
PABPC4Q13310 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 46.4
PABPC4Q13310 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 46.4
PABPC4Q13310 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 46.4
PABPC4Q13310 DLGAP5-201ENST00000247191 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 46.3
PABPC4Q13310 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.362e-6■■■■■ 46.3
PABPC4Q13310 DGKZ-224ENST00000534802 1999 ntTSL 221.26■□□□□ 0.999e-8■■■■■ 46.3
PABPC4Q13310 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.59e-8■■■■■ 46.3
PABPC4Q13310 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.389e-8■■■■■ 46.3
PABPC4Q13310 DGKZ-215ENST00000528173 5737 ntTSL 517.02■□□□□ 0.319e-8■■■■■ 46.3
PABPC4Q13310 CFAP20-203ENST00000562622 1605 ntTSL 516.47■□□□□ 0.237e-7■■■■■ 46.3
PABPC4Q13310 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.039e-8■■■■■ 46.3
PABPC4Q13310 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.047e-7■■■■■ 46.3
PABPC4Q13310 DGKZ-208ENST00000524984 3512 ntTSL 214.39□□□□□ -0.119e-8■■■■■ 46.3
PABPC4Q13310 DGKZ-211ENST00000527211 3679 ntTSL 1 (best)13.51□□□□□ -0.259e-8■■■■■ 46.3
PABPC4Q13310 CDK5-202ENST00000469108 582 ntTSL 326.81■■□□□ 1.883e-6■■■■■ 46.1
PABPC4Q13310 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.723e-6■■■■■ 46.1
PABPC4Q13310 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.693e-6■■■■■ 46.1
PABPC4Q13310 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 46.1
PABPC4Q13310 IMP4-210ENST00000462392 1793 ntTSL 322.94■■□□□ 1.267e-7■■■■■ 46
PABPC4Q13310 IMP4-208ENST00000460766 2379 ntTSL 1 (best)22.56■■□□□ 1.27e-7■■■■■ 46
PABPC4Q13310 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.63e-15■■■■■ 45.9
PABPC4Q13310 PRCC-202ENST00000454659 1084 ntTSL 316.97■□□□□ 0.313e-15■■■■■ 45.9
PABPC4Q13310 PRCC-204ENST00000469071 1969 ntTSL 212.25□□□□□ -0.453e-15■■■■■ 45.9
PABPC4Q13310 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.181e-7■■■■■ 45.8
PABPC4Q13310 RPL28-211ENST00000560881 1692 ntTSL 519.65■□□□□ 0.741e-323■■■■■ 45.8
PABPC4Q13310 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.591e-323■■■■■ 45.8
PABPC4Q13310 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.541e-323■■■■■ 45.8
PABPC4Q13310 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.312e-9■■■■■ 45.8
PABPC4Q13310 ADD2-210ENST00000456320 997 ntTSL 518■□□□□ 0.477e-9■■■■■ 45.7
PABPC4Q13310 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.077e-9■■■■■ 45.7
PABPC4Q13310 ADD2-205ENST00000413157 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.557e-9■■■■■ 45.7
PABPC4Q13310 ADD2-214ENST00000522886 874 ntTSL 510.67□□□□□ -0.77e-9■■■■■ 45.7
PABPC4Q13310 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.165e-12■■■■■ 45.6
PABPC4Q13310 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.215e-12■■■■■ 45.6
PABPC4Q13310 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.469e-10■■■■■ 45.6
PABPC4Q13310 AC073896.1-203ENST00000548360 512 ntTSL 423.2■■□□□ 1.39e-10■■■■■ 45.6
PABPC4Q13310 AC073896.1-202ENST00000547423 566 ntTSL 421.88■■□□□ 1.099e-10■■■■■ 45.6
PABPC4Q13310 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.079e-10■■■■■ 45.6
PABPC4Q13310 CNPY2-212ENST00000553191 621 ntTSL 26.99□□□□□ -1.299e-10■■■■■ 45.6
PABPC4Q13310 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.191e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.151e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 AC091959.3-201ENST00000506502 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.311e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 RBM27-201ENST00000265271 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.641e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 CUL3-207ENST00000451538 546 ntTSL 59.63□□□□□ -0.871e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 CUL3-208ENST00000454323 688 ntTSL 36.84□□□□□ -1.311e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 CUL3-212ENST00000497715 2400 ntTSL 25.73□□□□□ -1.491e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.541e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.781e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.881e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 RETSAT-205ENST00000449375 1759 ntTSL 517.27■□□□□ 0.356e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 BAIAP2-222ENST00000575841 509 ntTSL 214.72□□□□□ -0.056e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 RETSAT-203ENST00000429806 2335 ntTSL 1 (best)13.61□□□□□ -0.236e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 RETSAT-204ENST00000438611 1500 ntTSL 512.95□□□□□ -0.346e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 RETSAT-201ENST00000295802 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.666e-10■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 EMD-203ENST00000428228 946 ntTSL 320.92■□□□□ 0.943e-11■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 EMD-208ENST00000492448 832 ntTSL 219.64■□□□□ 0.733e-11■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 SYPL1-207ENST00000634737 835 ntTSL 57.39□□□□□ -1.233e-25■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.273e-25■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 SYPL1-204ENST00000464029 1017 ntTSL 26.36□□□□□ -1.393e-25■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 SYPL1-203ENST00000460770 545 ntTSL 1 (best)3.89□□□□□ -1.793e-25■■■■■ 45.5
PABPC4Q13310 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 45.4
PABPC4Q13310 PARK7-204ENST00000377493 795 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 45.4
PABPC4Q13310 PARK7-209ENST00000493678 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 45.4
PABPC4Q13310 CHCHD6-205ENST00000510044 670 ntTSL 221.09■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 45.4
PABPC4Q13310 CHCHD6-203ENST00000504973 562 ntTSL 319.79■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 45.4
PABPC4Q13310 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.021e-11■■■■■ 45.3
PABPC4Q13310 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.241e-11■■■■■ 45.3
PABPC4Q13310 DPP3-205ENST00000530165 2251 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.281e-11■■■■■ 45.3
PABPC4Q13310 DPP3-215ENST00000541961 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.31e-11■■■■■ 45.3
PABPC4Q13310 AP002748.4-201ENST00000419755 3547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.741e-11■■■■■ 45.3
PABPC4Q13310 COX5B-204ENST00000494306 738 ntTSL 215.08■□□□□ 02e-30■■■■■ 45.3
PABPC4Q13310 PACSIN3-209ENST00000532457 1845 ntTSL 525.09■■□□□ 1.618e-7■■■■■ 45.2
PABPC4Q13310 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.388e-7■■■■■ 45.2
PABPC4Q13310 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.178e-7■■■■■ 45.2
PABPC4Q13310 PACSIN3-210ENST00000533686 443 ntTSL 319.37■□□□□ 0.698e-7■■■■■ 45.2
PABPC4Q13310 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.424e-9■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 LAMTOR4-208ENST00000474831 564 ntTSL 316.42■□□□□ 0.224e-9■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 LAMTOR4-207ENST00000474141 519 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.214e-9■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 LAMTOR4-203ENST00000460732 616 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.394e-9■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 SELENBP1-207ENST00000443708 1724 ntTSL 519.37■□□□□ 0.699e-8■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.689e-8■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.659e-8■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 SELENBP1-212ENST00000463664 1922 ntTSL 518.07■□□□□ 0.489e-8■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 SELENBP1-202ENST00000423070 1887 ntTSL 516.63■□□□□ 0.259e-8■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.169e-8■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 SELENBP1-218ENST00000493560 1963 ntTSL 515.18■□□□□ 0.029e-8■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 SELENBP1-206ENST00000427977 1611 ntTSL 514.97□□□□□ -0.019e-8■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 SELENBP1-214ENST00000470345 2128 ntTSL 214.13□□□□□ -0.159e-8■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 SELENBP1-216ENST00000474352 2840 ntTSL 213.37□□□□□ -0.279e-8■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 SELENBP1-209ENST00000455397 1521 ntTSL 512.85□□□□□ -0.359e-8■■■■■ 45.1
PABPC4Q13310 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.975e-22■■■■■ 45
PABPC4Q13310 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.595e-22■■■■■ 45
PABPC4Q13310 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.343e-6■■■■■ 45
PABPC4Q13310 SRI-202ENST00000394641 653 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.016e-46■■■■■ 44.8
PABPC4Q13310 PPP5C-213ENST00000527623 1215 ntTSL 224.84■■□□□ 1.579e-28■■■■■ 44.8
PABPC4Q13310 C21orf59-206ENST00000440966 1082 ntTSL 322.83■■□□□ 1.251e-10■■■■■ 44.5
PABPC4Q13310 C21orf59-202ENST00000300260 1243 ntTSL 221.28■■□□□ 11e-10■■■■■ 44.5
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