Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SKP2Q13309 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKP2Q13309 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKP2Q13309 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SKP2Q13309 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SKP2Q13309 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SKP2Q13309 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SKP2Q13309 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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