Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RESTQ13127 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RESTQ13127 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RESTQ13127 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RESTQ13127 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RESTQ13127 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RESTQ13127 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RESTQ13127 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RESTQ13127 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RESTQ13127 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RESTQ13127 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RESTQ13127 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RESTQ13127 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RESTQ13127 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RESTQ13127 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RESTQ13127 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RESTQ13127 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RESTQ13127 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RESTQ13127 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RESTQ13127 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RESTQ13127 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RESTQ13127 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RESTQ13127 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RESTQ13127 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RESTQ13127 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RESTQ13127 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RESTQ13127 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RESTQ13127 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RESTQ13127 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RESTQ13127 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RESTQ13127 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RESTQ13127 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RESTQ13127 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RESTQ13127 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RESTQ13127 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RESTQ13127 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RESTQ13127 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RESTQ13127 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RESTQ13127 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RESTQ13127 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RESTQ13127 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RESTQ13127 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RESTQ13127 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RESTQ13127 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RESTQ13127 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RESTQ13127 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RESTQ13127 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RESTQ13127 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RESTQ13127 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RESTQ13127 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RESTQ13127 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RESTQ13127 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RESTQ13127 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RESTQ13127 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RESTQ13127 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RESTQ13127 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RESTQ13127 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RESTQ13127 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RESTQ13127 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RESTQ13127 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RESTQ13127 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RESTQ13127 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RESTQ13127 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RESTQ13127 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RESTQ13127 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RESTQ13127 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RESTQ13127 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RESTQ13127 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RESTQ13127 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RESTQ13127 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RESTQ13127 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RESTQ13127 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RESTQ13127 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RESTQ13127 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RESTQ13127 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RESTQ13127 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RESTQ13127 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RESTQ13127 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RESTQ13127 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RESTQ13127 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RESTQ13127 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RESTQ13127 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RESTQ13127 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RESTQ13127 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RESTQ13127 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RESTQ13127 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RESTQ13127 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RESTQ13127 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RESTQ13127 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RESTQ13127 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RESTQ13127 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RESTQ13127 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RESTQ13127 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RESTQ13127 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RESTQ13127 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RESTQ13127 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RESTQ13127 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RESTQ13127 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RESTQ13127 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RESTQ13127 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
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