Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
GRIN2AQ12879 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
GRIN2AQ12879 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
GRIN2AQ12879 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
GRIN2AQ12879 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
GRIN2AQ12879 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
GRIN2AQ12879 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
GRIN2AQ12879 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
GRIN2AQ12879 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
GRIN2AQ12879 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
GRIN2AQ12879 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC40.7■■■■■ 4.11
GRIN2AQ12879 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
GRIN2AQ12879 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
GRIN2AQ12879 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
GRIN2AQ12879 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
GRIN2AQ12879 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
GRIN2AQ12879 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
GRIN2AQ12879 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
GRIN2AQ12879 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
GRIN2AQ12879 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
GRIN2AQ12879 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
GRIN2AQ12879 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
GRIN2AQ12879 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC40.67■■■■■ 4.1
GRIN2AQ12879 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
GRIN2AQ12879 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
GRIN2AQ12879 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
GRIN2AQ12879 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
GRIN2AQ12879 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
GRIN2AQ12879 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
GRIN2AQ12879 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
GRIN2AQ12879 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
GRIN2AQ12879 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
GRIN2AQ12879 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
GRIN2AQ12879 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
GRIN2AQ12879 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
GRIN2AQ12879 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
GRIN2AQ12879 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
GRIN2AQ12879 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
GRIN2AQ12879 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.62■■■■■ 4.09
GRIN2AQ12879 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
GRIN2AQ12879 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
GRIN2AQ12879 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
GRIN2AQ12879 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
GRIN2AQ12879 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
GRIN2AQ12879 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
GRIN2AQ12879 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
GRIN2AQ12879 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
GRIN2AQ12879 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
GRIN2AQ12879 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
GRIN2AQ12879 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
GRIN2AQ12879 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
GRIN2AQ12879 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
GRIN2AQ12879 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
GRIN2AQ12879 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
GRIN2AQ12879 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
GRIN2AQ12879 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
GRIN2AQ12879 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
GRIN2AQ12879 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.08
GRIN2AQ12879 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
GRIN2AQ12879 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
GRIN2AQ12879 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
GRIN2AQ12879 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
GRIN2AQ12879 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
GRIN2AQ12879 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
GRIN2AQ12879 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
GRIN2AQ12879 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
GRIN2AQ12879 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
GRIN2AQ12879 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
GRIN2AQ12879 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
GRIN2AQ12879 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
GRIN2AQ12879 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
GRIN2AQ12879 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
GRIN2AQ12879 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
GRIN2AQ12879 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
GRIN2AQ12879 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
GRIN2AQ12879 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
GRIN2AQ12879 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
GRIN2AQ12879 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC40.49■■■■■ 4.07
GRIN2AQ12879 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
GRIN2AQ12879 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
GRIN2AQ12879 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
GRIN2AQ12879 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
GRIN2AQ12879 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
GRIN2AQ12879 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
GRIN2AQ12879 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
GRIN2AQ12879 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
GRIN2AQ12879 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
GRIN2AQ12879 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms