Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNH2Q12809 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNH2Q12809 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KCNH2Q12809 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNH2Q12809 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNH2Q12809 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNH2Q12809 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNH2Q12809 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNH2Q12809 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNH2Q12809 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNH2Q12809 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNH2Q12809 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCNH2Q12809 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNH2Q12809 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH2Q12809 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms