Protein–RNA interactions for Protein: Q12697

YPK9, Vacuolar cation-transporting ATPase YPK9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPK9Q12697 KSH1YNL024C-A 219 nt10.35□□□□□ -0.75
YPK9Q12697 MRPS12YNR036C 462 nt10.35□□□□□ -0.75
YPK9Q12697 MEX67YPL169C 1800 nt10.34□□□□□ -0.75
YPK9Q12697 CEM1YER061C 1329 nt10.33□□□□□ -0.76
YPK9Q12697 YPL257WYPL257W 582 nt10.33□□□□□ -0.76
YPK9Q12697 MAL31YBR298C 1845 nt10.33□□□□□ -0.76
YPK9Q12697 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.32□□□□□ -0.76
YPK9Q12697 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.32□□□□□ -0.76
YPK9Q12697 FAL1YDR021W 1200 nt10.32□□□□□ -0.76
YPK9Q12697 AAT2YLR027C 1257 nt10.32□□□□□ -0.76
YPK9Q12697 ARE2YNR019W 1929 nt10.32□□□□□ -0.76
YPK9Q12697 POX1YGL205W 2247 nt10.31□□□□□ -0.76
YPK9Q12697 YDL177CYDL177C 513 nt10.31□□□□□ -0.76
YPK9Q12697 MNS1YJR131W 1650 nt10.31□□□□□ -0.76
YPK9Q12697 UTP4YDR324C 2331 nt10.31□□□□□ -0.76
YPK9Q12697 TDP1YBR223C 1635 nt10.31□□□□□ -0.76
YPK9Q12697 YBR241CYBR241C 1467 nt10.3□□□□□ -0.76
YPK9Q12697 AMN1YBR158W 1650 nt10.3□□□□□ -0.76
YPK9Q12697 COX10YPL172C 1389 nt10.29□□□□□ -0.76
YPK9Q12697 HEM2YGL040C 1029 nt10.29□□□□□ -0.76
YPK9Q12697 YJR146WYJR146W 354 nt10.29□□□□□ -0.76
YPK9Q12697 RUF23RUF23 254 nt10.29□□□□□ -0.76
YPK9Q12697 PPT1YGR123C 1542 nt10.28□□□□□ -0.76
YPK9Q12697 YJR154WYJR154W 1041 nt10.28□□□□□ -0.76
YPK9Q12697 YNL285WYNL285W 372 nt10.27□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 STT3YGL022W 2157 nt10.27□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 TRS31YDR472W 852 nt10.26□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt10.26□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 SUF16tG(GCC)C 71 nt10.26□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt10.26□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt10.26□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt10.26□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 SUF20tG(GCC)F1 71 nt10.26□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt10.26□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt10.26□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt10.26□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt10.26□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 SUF23tG(GCC)J2 71 nt10.26□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt10.26□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt10.26□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 SUF17tG(GCC)O2 71 nt10.26□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt10.26□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt10.26□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 RPL10YLR075W 666 nt10.26□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 PAC2YER007W 1557 nt10.26□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 MRPL28YDR462W 444 nt10.25□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 MTC2YKL098W 1074 nt10.25□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 ECM14YHR132C 1293 nt10.23□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 FLC2YAL053W 2352 nt10.23□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 MAK31YCR020C-A 267 nt10.23□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 YJR084WYJR084W 1272 nt10.23□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 SKS1YPL026C 1509 nt10.22□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 GTO3YMR251W 1101 nt10.22□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 RFC4YOL094C 972 nt10.22□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 YPL264CYPL264C 1062 nt10.22□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 CAN1YEL063C 1773 nt10.21□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 RMD8YFR048W 1989 nt10.21□□□□□ -0.77
YPK9Q12697 YET3YDL072C 612 nt10.21□□□□□ -0.78
YPK9Q12697 NPP1YCR026C 2229 nt10.2□□□□□ -0.78
YPK9Q12697 RPS5YJR123W 678 nt10.2□□□□□ -0.78
YPK9Q12697 SNT309YPR101W 528 nt10.2□□□□□ -0.78
YPK9Q12697 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt10.19□□□□□ -0.78
YPK9Q12697 CAF40YNL288W 1122 nt10.19□□□□□ -0.78
YPK9Q12697 RFS1YBR052C 633 nt10.18□□□□□ -0.78
YPK9Q12697 CCC2YDR270W 3015 nt10.18□□□□□ -0.78
YPK9Q12697 CRF1YDR223W 1404 nt10.17□□□□□ -0.78
YPK9Q12697 CDC19YAL038W 1503 nt10.17□□□□□ -0.78
YPK9Q12697 snR82snR82 268 nt10.17□□□□□ -0.78
YPK9Q12697 PRS2YER099C 957 nt10.17□□□□□ -0.78
YPK9Q12697 MDE1YJR024C 735 nt10.17□□□□□ -0.78
YPK9Q12697 OPI11YPR044C 354 nt10.17□□□□□ -0.78
YPK9Q12697 GON7YJL184W 372 nt10.16□□□□□ -0.78
YPK9Q12697 IRC11YOR013W 471 nt10.16□□□□□ -0.78
YPK9Q12697 EDE1YBL047C 4146 nt10.15□□□□□ -0.78
YPK9Q12697 MHP1YJL042W 4197 nt10.15□□□□□ -0.78
YPK9Q12697 MDL2YPL270W 2322 nt10.13□□□□□ -0.79
YPK9Q12697 HXT9YJL219W 1704 nt10.11□□□□□ -0.79
YPK9Q12697 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt10.11□□□□□ -0.79
YPK9Q12697 AMD2YDR242W 1650 nt10.11□□□□□ -0.79
YPK9Q12697 JNM1YMR294W 1122 nt10.1□□□□□ -0.79
YPK9Q12697 RPP1YHR062C 882 nt10.1□□□□□ -0.79
YPK9Q12697 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt10.1□□□□□ -0.79
YPK9Q12697 SKG1YKR100C 1068 nt10.09□□□□□ -0.79
YPK9Q12697 ICL1YER065C 1674 nt10.09□□□□□ -0.79
YPK9Q12697 ENB1YOL158C 1821 nt10.09□□□□□ -0.79
YPK9Q12697 ILV1YER086W 1731 nt10.08□□□□□ -0.8
YPK9Q12697 HST3YOR025W 1344 nt10.08□□□□□ -0.8
YPK9Q12697 YRF1-2YER190W 5046 nt10.08□□□□□ -0.8
YPK9Q12697 RDN5-2RDN5-2 119 nt10.08□□□□□ -0.8
YPK9Q12697 RDN5-3RDN5-3 119 nt10.08□□□□□ -0.8
YPK9Q12697 RDN5-4RDN5-4 119 nt10.08□□□□□ -0.8
YPK9Q12697 RDN5-5RDN5-5 119 nt10.08□□□□□ -0.8
YPK9Q12697 RHB1YCR027C 630 nt10.07□□□□□ -0.8
YPK9Q12697 SNF4YGL115W 969 nt10.07□□□□□ -0.8
YPK9Q12697 YKR018CYKR018C 2178 nt10.07□□□□□ -0.8
YPK9Q12697 SPT3YDR392W 1014 nt10.06□□□□□ -0.8
YPK9Q12697 RPS3YNL178W 723 nt10.06□□□□□ -0.8
YPK9Q12697 ISN1YOR155C 1353 nt10.06□□□□□ -0.8
YPK9Q12697 LDB16YCL005W 771 nt10.05□□□□□ -0.8
YPK9Q12697 HRQ1YDR291W 3234 nt10.05□□□□□ -0.8
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