Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 RHO1YPR165W 630 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 MST1YKL194C 1389 nt7.05□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 PUP3YER094C 618 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 IBD2YNL164C 1056 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 VPS68YOL129W 555 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 AVL9YLR114C 2295 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 APM4YOL062C 1476 nt7.04□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 MTC6YHR151C 1581 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 PDC5YLR134W 1692 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 OCH1YGL038C 1443 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 SHC1YER096W 1539 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 GLE1YDL207W 1617 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 CYC3YAL039C 810 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 YLR407WYLR407W 687 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 HRT1YOL133W 366 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 TFB6YOR352W 1032 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 HXT8YJL214W 1710 nt7.03□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 RPN5YDL147W 1338 nt7.02□□□□□ -1.28
TY1A-NL1Q12391 PEX28YHR150W 1740 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 ERJ5YFR041C 888 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 YSC83YHR017W 1158 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 SNP1YIL061C 903 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 CDA1YLR307W 906 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 STP3YLR375W 1032 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 ATP10YLR393W 840 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 YLH47YPR125W 1365 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 TOP3YLR234W 1971 nt7.02□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 ERO1YML130C 1692 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 THI73YLR004C 1572 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 SAL1YNL083W 1485 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 ADH7YCR105W 1086 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 YDR336WYDR336W 945 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 TES1YJR019C 1050 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 YLL047WYLL047W 384 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 GPI2YPL076W 843 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 ARG7YMR062C 1326 nt7.01□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 PHM8YER037W 966 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 LST7YGR057C 729 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 SAY1YGR263C 1275 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 ERG6YML008C 1152 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 IPL1YPL209C 1104 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 RUP1YOR138C 2016 nt7□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 DUO1YGL061C 744 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 YIR043CYIR043C 693 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 YML090WYML090W 387 nt6.99□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 YGL101WYGL101W 648 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 YGL218WYGL218W 651 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 YLR030WYLR030W 792 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 BLS1YLR408C 369 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 YMR166CYMR166C 1107 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 RUF5-1RUF5-1 710 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 RUF5-2RUF5-2 710 nt6.98□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 VAC17YCL063W 1272 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 RPN9YDR427W 1182 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 CAK1YFL029C 1107 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 TVP38YKR088C 1014 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 MFA2YNL145W 117 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 PBP2YBR233W 1242 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 RTG2YGL252C 1767 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 ERR3YMR323W 1314 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 ERR1YOR393W 1314 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 ERR2YPL281C 1314 nt6.97□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 YHR131CYHR131C 2553 nt6.96□□□□□ -1.29
TY1A-NL1Q12391 ADE5,7YGL234W 2409 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 snR56snR56 88 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 SDS22YKL193C 1017 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YMR253CYMR253C 1245 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 JNM1YMR294W 1122 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YNL171CYNL171C 369 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 TLG2YOL018C 1194 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 MRPL23YOR150W 492 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 TIP41YPR040W 1071 nt6.96□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 PRP9YDL030W 1593 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YFT2YDR319C 825 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 RAD51YER095W 1203 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YFL019CYFL019C 354 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 PAU15YIR041W 375 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 MPM1YJL066C 759 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YAL064WYAL064W 285 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YLR271WYLR271W 825 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 RRP14YKL082C 1305 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YFL052WYFL052W 1398 nt6.95□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YDL114WYDL114W 927 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 GTO1YGR154C 1071 nt6.94□□□□□ -1.3
TY1A-NL1Q12391 YIL086CYIL086C 309 nt6.94□□□□□ -1.3
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