Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 LOT6YLR011W 576 nt7.63□□□□□ -1.19
CLF1Q12309 TMA46YOR091W 1038 nt7.63□□□□□ -1.19
CLF1Q12309 TOM20YGR082W 552 nt7.62□□□□□ -1.19
CLF1Q12309 YPL277CYPL277C 1464 nt7.62□□□□□ -1.19
CLF1Q12309 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt7.61□□□□□ -1.19
CLF1Q12309 SEC62YPL094C 825 nt7.61□□□□□ -1.19
CLF1Q12309 YBR113WYBR113W 483 nt7.61□□□□□ -1.19
CLF1Q12309 ICL2YPR006C 1728 nt7.61□□□□□ -1.19
CLF1Q12309 MAK32YCR019W 1092 nt7.6□□□□□ -1.19
CLF1Q12309 SNF4YGL115W 969 nt7.6□□□□□ -1.19
CLF1Q12309 OM45YIL136W 1182 nt7.6□□□□□ -1.19
CLF1Q12309 SPG1YGR236C 288 nt7.59□□□□□ -1.19
CLF1Q12309 RBS1YDL189W 1374 nt7.59□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 TUF1YOR187W 1314 nt7.58□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 ENB1YOL158C 1821 nt7.58□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 AIM2YAL049C 741 nt7.58□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 PUS5YLR165C 765 nt7.58□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 YNL092WYNL092W 1203 nt7.58□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 SNT309YPR101W 528 nt7.58□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 AGP2YBR132C 1791 nt7.58□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 YHK8YHR048W 1545 nt7.57□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 CIT3YPR001W 1461 nt7.57□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 QCR6YFR033C 444 nt7.57□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 PPM2YOL141W 2088 nt7.56□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 CBR1YIL043C 855 nt7.56□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 YRB2YIL063C 984 nt7.56□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 ATG36YJL185C 882 nt7.56□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 YLR112WYLR112W 420 nt7.56□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 FET4YMR319C 1659 nt7.55□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 YDL177CYDL177C 513 nt7.55□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt7.55□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 YAR064WYAR064W 300 nt7.55□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 CUE4YML101C 354 nt7.55□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 PRY3YJL078C 2646 nt7.55□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 ERG8YMR220W 1356 nt7.55□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 AMN1YBR158W 1650 nt7.54□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 MRPL28YDR462W 444 nt7.54□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 TFG2YGR005C 1203 nt7.54□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt7.54□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 YBL112CYBL112C 318 nt7.54□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 HIS1YER055C 894 nt7.53□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 FHN1YGR131W 525 nt7.53□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 MTR3YGR158C 753 nt7.53□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 FRE5YOR384W 2085 nt7.53□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 CEM1YER061C 1329 nt7.52□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 DOT1YDR440W 1749 nt7.52□□□□□ -1.2
CLF1Q12309 SNU71YGR013W 1863 nt7.52□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 BNS1YGR230W 414 nt7.52□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 YKL077WYKL077W 1179 nt7.52□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 DRE2YKR071C 1047 nt7.52□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 RFS1YBR052C 633 nt7.52□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 YHR020WYHR020W 2067 nt7.51□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 COX10YPL172C 1389 nt7.51□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 YSC83YHR017W 1158 nt7.51□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 MHT1YLL062C 975 nt7.51□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt7.51□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 YMR252CYMR252C 405 nt7.51□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 OSW2YLR054C 2175 nt7.51□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 PPS1YBR276C 2424 nt7.51□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 GYP8YFL027C 1494 nt7.5□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 REC114YMR133W 1287 nt7.5□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 SHO1YER118C 1104 nt7.49□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.49□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.49□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.49□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.49□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 MRPL23YOR150W 492 nt7.49□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 PAC2YER007W 1557 nt7.49□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 GFA1YKL104C 2154 nt7.49□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 IMD1YAR073W 1212 nt7.48□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 COQ1YBR003W 1422 nt7.48□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 YBR027CYBR027C 333 nt7.48□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 EHD3YDR036C 1503 nt7.47□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 FYV1YDR024W 486 nt7.47□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 TSR2YLR435W 618 nt7.47□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 YMR122CYMR122C 375 nt7.47□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 YBR226CYBR226C 411 nt7.47□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 UIP5YKR044W 1332 nt7.47□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 CDC16YKL022C 2523 nt7.46□□□□□ -1.21
CLF1Q12309 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.46□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 TDH2YJR009C 999 nt7.46□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 SCS7YMR272C 1155 nt7.46□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 RRP9YPR137W 1722 nt7.45□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 TRR1YDR353W 960 nt7.45□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 TRS31YDR472W 852 nt7.45□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt7.45□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 ERP2YAL007C 648 nt7.45□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 YKR045CYKR045C 552 nt7.45□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 ECM30YLR436C 3825 nt7.45□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 YBL070CYBL070C 321 nt7.45□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 ZWF1YNL241C 1518 nt7.45□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 RUF23RUF23 254 nt7.44□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 ARC35YNR035C 1029 nt7.44□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 RFC4YOL094C 972 nt7.44□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 YOR012WYOR012W 414 nt7.44□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 ERG12YMR208W 1332 nt7.44□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 MCH2YKL221W 1422 nt7.44□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 CDC1YDR182W 1476 nt7.43□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 YDR187CYDR187C 519 nt7.43□□□□□ -1.22
CLF1Q12309 VMA3YEL027W 483 nt7.43□□□□□ -1.22
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