Protein–RNA interactions for Protein: Q12159

YRA1, RNA annealing protein YRA1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRA1Q12159 AQR1YNL065W 1761 nt6.03□□□□□ -1.44
YRA1Q12159 TUF1YOR187W 1314 nt6.03□□□□□ -1.44
YRA1Q12159 HXT15YDL245C 1704 nt6.03□□□□□ -1.44
YRA1Q12159 HXT16YJR158W 1704 nt6.03□□□□□ -1.44
YRA1Q12159 MRPL28YDR462W 444 nt6.03□□□□□ -1.44
YRA1Q12159 CBR1YIL043C 855 nt6.03□□□□□ -1.44
YRA1Q12159 URH1YDR400W 1023 nt6.02□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 TRS31YDR472W 852 nt6.02□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 LSC1YOR142W 990 nt6.02□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 RFS1YBR052C 633 nt6.02□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 LCL3YGL085W 825 nt6.01□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 MTR3YGR158C 753 nt6.01□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 ERP2YAL007C 648 nt6.01□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 ICL2YPR006C 1728 nt6□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 YBR113WYBR113W 483 nt6□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 PAC2YER007W 1557 nt6□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 DOT1YDR440W 1749 nt5.99□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 NMT1YLR195C 1368 nt5.99□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 HED1YDR014W-A 489 nt5.99□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 MED6YHR058C 888 nt5.99□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 YMR034CYMR034C 1305 nt5.99□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 ERS1YCR075C 783 nt5.98□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 PAC10YGR078C 600 nt5.98□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 YSC83YHR017W 1158 nt5.98□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.98□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 ASF1YJL115W 840 nt5.98□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 YKL077WYKL077W 1179 nt5.98□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 YKL102CYKL102C 306 nt5.98□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 DRE2YKR071C 1047 nt5.98□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 SWD1YAR003W 1281 nt5.98□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 MCH2YKL221W 1422 nt5.98□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 POX1YGL205W 2247 nt5.98□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 SAL1YNL083W 1485 nt5.97□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 YDL177CYDL177C 513 nt5.97□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 FMO1YHR176W 1299 nt5.97□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt5.97□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 YNL017CYNL017C 339 nt5.97□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 YNL092WYNL092W 1203 nt5.97□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 ARC35YNR035C 1029 nt5.97□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 TMA46YOR091W 1038 nt5.97□□□□□ -1.45
YRA1Q12159 YOR200WYOR200W 399 nt5.96□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 ILV6YCL009C 930 nt5.96□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 ERG12YMR208W 1332 nt5.96□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.95□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 RDN5-3RDN5-3 119 nt5.95□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 RDN5-4RDN5-4 119 nt5.95□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 RDN5-5RDN5-5 119 nt5.95□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 TAF9YMR236W 474 nt5.95□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 SLA2YNL243W 2907 nt5.95□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 MRPS18YNL306W 654 nt5.95□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 YHR020WYHR020W 2067 nt5.95□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 RGD2YFL047W 2145 nt5.95□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 SLX5YDL013W 1860 nt5.94□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 GDA1YEL042W 1557 nt5.94□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 HHY1YEL059W 309 nt5.94□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.94□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 YBL112CYBL112C 318 nt5.94□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 MRPL23YOR150W 492 nt5.94□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 HBN1YCL026C-B 582 nt5.94□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 CCT3YJL014W 1605 nt5.94□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 YBR241CYBR241C 1467 nt5.94□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 COQ1YBR003W 1422 nt5.93□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 TRR1YDR353W 960 nt5.93□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 RNH1YMR234W 1047 nt5.93□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 HXT17YNR072W 1695 nt5.93□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 HIS7YBR248C 1659 nt5.93□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 TAH11YJR046W 1815 nt5.92□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 FRE5YOR384W 2085 nt5.92□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 CDC16YKL022C 2523 nt5.92□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 GCG1YER163C 699 nt5.92□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.92□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 IRC11YOR013W 471 nt5.92□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 CYB2YML054C 1776 nt5.92□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 PPM2YOL141W 2088 nt5.92□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 GPH1YPR160W 2709 nt5.91□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 MIP1YOR330C 3765 nt5.91□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 STT3YGL022W 2157 nt5.9□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 IMG1YCR046C 510 nt5.9□□□□□ -1.46
YRA1Q12159 GSH1YJL101C 2037 nt5.9□□□□□ -1.47
YRA1Q12159 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.89□□□□□ -1.47
YRA1Q12159 RRP46YGR095C 672 nt5.89□□□□□ -1.47
YRA1Q12159 YRB2YIL063C 984 nt5.89□□□□□ -1.47
YRA1Q12159 YLR463CYLR463C 552 nt5.89□□□□□ -1.47
YRA1Q12159 YNR014WYNR014W 639 nt5.89□□□□□ -1.47
YRA1Q12159 GAA1YLR088W 1845 nt5.89□□□□□ -1.47
YRA1Q12159 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.88□□□□□ -1.47
YRA1Q12159 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.88□□□□□ -1.47
YRA1Q12159 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.88□□□□□ -1.47
YRA1Q12159 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.88□□□□□ -1.47
YRA1Q12159 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.88□□□□□ -1.47
YRA1Q12159 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.88□□□□□ -1.47
YRA1Q12159 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.88□□□□□ -1.47
YRA1Q12159 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.88□□□□□ -1.47
YRA1Q12159 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.88□□□□□ -1.47
YRA1Q12159 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.88□□□□□ -1.47
YRA1Q12159 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.88□□□□□ -1.47
YRA1Q12159 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.88□□□□□ -1.47
YRA1Q12159 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.88□□□□□ -1.47
YRA1Q12159 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.88□□□□□ -1.47
YRA1Q12159 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 61.7 ms