Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZUP1

Klrb1, Killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrb1Q0ZUP1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klrb1Q0ZUP1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klrb1Q0ZUP1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klrb1Q0ZUP1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klrb1Q0ZUP1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klrb1Q0ZUP1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klrb1Q0ZUP1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klrb1Q0ZUP1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Klrb1Q0ZUP1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klrb1Q0ZUP1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klrb1Q0ZUP1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klrb1Q0ZUP1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klrb1Q0ZUP1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klrb1Q0ZUP1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klrb1Q0ZUP1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klrb1Q0ZUP1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klrb1Q0ZUP1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klrb1Q0ZUP1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Klrb1Q0ZUP1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klrb1Q0ZUP1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klrb1Q0ZUP1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms