Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ppp4r2Q0VGB7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppp4r2Q0VGB7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ppp4r2Q0VGB7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppp4r2Q0VGB7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppp4r2Q0VGB7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppp4r2Q0VGB7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppp4r2Q0VGB7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppp4r2Q0VGB7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppp4r2Q0VGB7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppp4r2Q0VGB7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppp4r2Q0VGB7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ppp4r2Q0VGB7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ppp4r2Q0VGB7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppp4r2Q0VGB7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppp4r2Q0VGB7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ppp4r2Q0VGB7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppp4r2Q0VGB7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppp4r2Q0VGB7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppp4r2Q0VGB7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppp4r2Q0VGB7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppp4r2Q0VGB7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppp4r2Q0VGB7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppp4r2Q0VGB7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppp4r2Q0VGB7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppp4r2Q0VGB7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppp4r2Q0VGB7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppp4r2Q0VGB7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppp4r2Q0VGB7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppp4r2Q0VGB7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppp4r2Q0VGB7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms