Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem52bQ0VBF2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem52bQ0VBF2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem52bQ0VBF2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms