Protein–RNA interactions for Protein: Q08AN1

ZNF616, Zinc finger protein 616, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF616Q08AN1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF616Q08AN1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF616Q08AN1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF616Q08AN1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms