Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH3

ACSM2A, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2AQ08AH3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACSM2AQ08AH3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACSM2AQ08AH3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSM2AQ08AH3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms