Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 TOM71YHR117W 1920 nt8□□□□□ -1.13
CTI6Q08923 YRB2YIL063C 984 nt8□□□□□ -1.13
CTI6Q08923 VPS24YKL041W 675 nt8□□□□□ -1.13
CTI6Q08923 YMR279CYMR279C 1623 nt8□□□□□ -1.13
CTI6Q08923 GPH1YPR160W 2709 nt7.99□□□□□ -1.13
CTI6Q08923 HED1YDR014W-A 489 nt7.99□□□□□ -1.13
CTI6Q08923 RFS1YBR052C 633 nt7.99□□□□□ -1.13
CTI6Q08923 YIL108WYIL108W 2091 nt7.99□□□□□ -1.13
CTI6Q08923 PPS1YBR276C 2424 nt7.98□□□□□ -1.13
CTI6Q08923 CTF19YPL018W 1110 nt7.98□□□□□ -1.13
CTI6Q08923 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt7.97□□□□□ -1.13
CTI6Q08923 YAR064WYAR064W 300 nt7.97□□□□□ -1.13
CTI6Q08923 YOR012WYOR012W 414 nt7.97□□□□□ -1.13
CTI6Q08923 TMA46YOR091W 1038 nt7.97□□□□□ -1.13
CTI6Q08923 YPR127WYPR127W 1038 nt7.97□□□□□ -1.13
CTI6Q08923 MSG5YNL053W 1470 nt7.97□□□□□ -1.13
CTI6Q08923 SEC23YPR181C 2307 nt7.97□□□□□ -1.13
CTI6Q08923 YHK8YHR048W 1545 nt7.97□□□□□ -1.13
CTI6Q08923 SYF2YGR129W 648 nt7.96□□□□□ -1.14
CTI6Q08923 YDL172CYDL172C 480 nt7.95□□□□□ -1.14
CTI6Q08923 CSL4YNL232W 879 nt7.95□□□□□ -1.14
CTI6Q08923 CDC13YDL220C 2775 nt7.95□□□□□ -1.14
CTI6Q08923 YLL066CYLL066C 3618 nt7.95□□□□□ -1.14
CTI6Q08923 YLL067CYLL067C 3618 nt7.95□□□□□ -1.14
CTI6Q08923 ERG1YGR175C 1491 nt7.94□□□□□ -1.14
CTI6Q08923 TIF2YJL138C 1188 nt7.94□□□□□ -1.14
CTI6Q08923 TIF1YKR059W 1188 nt7.94□□□□□ -1.14
CTI6Q08923 MSO1YNR049C 633 nt7.94□□□□□ -1.14
CTI6Q08923 YPL102CYPL102C 303 nt7.94□□□□□ -1.14
CTI6Q08923 EFM1YHL039W 1758 nt7.94□□□□□ -1.14
CTI6Q08923 HHY1YEL059W 309 nt7.93□□□□□ -1.14
CTI6Q08923 EGD2YHR193C 525 nt7.92□□□□□ -1.14
CTI6Q08923 SIT4YDL047W 936 nt7.91□□□□□ -1.14
CTI6Q08923 SNF4YGL115W 969 nt7.91□□□□□ -1.14
CTI6Q08923 COQ1YBR003W 1422 nt7.91□□□□□ -1.14
CTI6Q08923 MLS1YNL117W 1665 nt7.91□□□□□ -1.14
CTI6Q08923 TIM22YDL217C 624 nt7.9□□□□□ -1.14
CTI6Q08923 ERP5YHR110W 639 nt7.9□□□□□ -1.14
CTI6Q08923 DON1YDR273W 1098 nt7.89□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 SLA2YNL243W 2907 nt7.89□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 PTC3YBL056W 1407 nt7.88□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 SRF1YDL133W 1314 nt7.88□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 TRS31YDR472W 852 nt7.88□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 CBR1YIL043C 855 nt7.88□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 SRL2YLR082C 1179 nt7.88□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 TSR3YOR006C 942 nt7.88□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 IRC5YFR038W 2562 nt7.87□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 PSR2YLR019W 1194 nt7.87□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 SUR7YML052W 909 nt7.87□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 RVB2YPL235W 1416 nt7.86□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 NDE1YMR145C 1683 nt7.86□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 DOT5YIL010W 648 nt7.86□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 MIX17YMR002W 471 nt7.86□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 COX10YPL172C 1389 nt7.85□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 YMR034CYMR034C 1305 nt7.85□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 DID2YKR035W-A 615 nt7.85□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 ECM19YLR390W 339 nt7.85□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 YNL200CYNL200C 741 nt7.85□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 GSH1YJL101C 2037 nt7.85□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 YCR041WYCR041W 333 nt7.84□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 PAC10YGR078C 600 nt7.84□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 YSC83YHR017W 1158 nt7.84□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 YLR112WYLR112W 420 nt7.84□□□□□ -1.15
CTI6Q08923 KIN1YDR122W 3195 nt7.83□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 YHR020WYHR020W 2067 nt7.83□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 YOR389WYOR389W 1875 nt7.83□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 MIP1YOR330C 3765 nt7.83□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 TDP1YBR223C 1635 nt7.83□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 SDH4YDR178W 546 nt7.83□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 URH1YDR400W 1023 nt7.83□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 GLC8YMR311C 690 nt7.83□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 PTC4YBR125C 1182 nt7.83□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 ARE2YNR019W 1929 nt7.83□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 MTF2YDL044C 1323 nt7.82□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.82□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 SHP1YBL058W 1272 nt7.82□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt7.82□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 ENV7YPL236C 1095 nt7.82□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 CCT3YJL014W 1605 nt7.81□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 BUD32YGR262C 786 nt7.81□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 CBK1YNL161W 2271 nt7.8□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt7.8□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 GTO3YMR251W 1101 nt7.8□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 YNL040WYNL040W 1371 nt7.8□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 CEM1YER061C 1329 nt7.79□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 FRA1YLL029W 2250 nt7.79□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 snR82snR82 268 nt7.79□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 LYS1YIR034C 1122 nt7.79□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 YNL017CYNL017C 339 nt7.79□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 FAL1YDR021W 1200 nt7.78□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 YNL285WYNL285W 372 nt7.78□□□□□ -1.16
CTI6Q08923 YDL177CYDL177C 513 nt7.77□□□□□ -1.17
CTI6Q08923 YDL218WYDL218W 954 nt7.77□□□□□ -1.17
CTI6Q08923 PPM2YOL141W 2088 nt7.77□□□□□ -1.17
CTI6Q08923 YGR054WYGR054W 1929 nt7.76□□□□□ -1.17
CTI6Q08923 RFC4YOL094C 972 nt7.76□□□□□ -1.17
CTI6Q08923 HEM2YGL040C 1029 nt7.75□□□□□ -1.17
CTI6Q08923 CRF1YDR223W 1404 nt7.75□□□□□ -1.17
CTI6Q08923 RQC1YDR333C 2172 nt7.74□□□□□ -1.17
CTI6Q08923 AMN1YBR158W 1650 nt7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44 ms