Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCK1Q08629 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCK1Q08629 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPOCK1Q08629 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCK1Q08629 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms