RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: Q08490
SGO1, Shugoshin, yeast
Predictions only
Length
590 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SGO1
Q08490
RNH201
YNL072W
924 nt
7.04
□□□□□ -1.28
SGO1
Q08490
NUP49
YGL172W
1419 nt
7.03
□□□□□ -1.28
SGO1
Q08490
SNF4
YGL115W
969 nt
7.03
□□□□□ -1.28
SGO1
Q08490
YMR122C
YMR122C
375 nt
7.03
□□□□□ -1.28
SGO1
Q08490
OCA1
YNL099C
717 nt
7.03
□□□□□ -1.28
SGO1
Q08490
YBR113W
YBR113W
483 nt
7.03
□□□□□ -1.28
SGO1
Q08490
PRP2
YNR011C
2631 nt
7.03
□□□□□ -1.28
SGO1
Q08490
SIR2
YDL042C
1689 nt
7.03
□□□□□ -1.28
SGO1
Q08490
PRE3
YJL001W
648 nt
7.02
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
LOT6
YLR011W
576 nt
7.02
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
FPR3
YML074C
1236 nt
7.02
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
SNU71
YGR013W
1863 nt
7.01
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
TPI1
YDR050C
747 nt
7.01
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
ORM1
YGR038W
669 nt
7.01
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
PAC10
YGR078C
600 nt
7.01
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
TDH2
YJR009C
999 nt
7.01
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
MSS51
YLR203C
1311 nt
7.01
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
YDR187C
YDR187C
519 nt
7
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
NTG2
YOL043C
1143 nt
7
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
YOL099C
YOL099C
492 nt
7
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
ERG8
YMR220W
1356 nt
6.99
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
FCY2
YER056C
1602 nt
6.99
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
COS6
YGR295C
1146 nt
6.99
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
YLL058W
YLL058W
1728 nt
6.98
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
AIM2
YAL049C
741 nt
6.98
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
TSR2
YLR435W
618 nt
6.98
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
ECM30
YLR436C
3825 nt
6.98
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
ADE17
YMR120C
1779 nt
6.97
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
SKY1
YMR216C
2229 nt
6.97
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
SGV1
YPR161C
1974 nt
6.97
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
HIS1
YER055C
894 nt
6.97
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
RSP5
YER125W
2430 nt
6.97
□□□□□ -1.29
SGO1
Q08490
SUF3
tG(CCC)D
72 nt
6.96
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
OM45
YIL136W
1182 nt
6.96
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
RRN10
YBL025W
438 nt
6.96
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
YMR295C
YMR295C
594 nt
6.96
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
ADH5
YBR145W
1056 nt
6.96
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
NUP84
YDL116W
2181 nt
6.95
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
SGE1
YPR198W
1632 nt
6.95
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
YCR041W
YCR041W
333 nt
6.95
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
MSP1
YGR028W
1089 nt
6.95
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
SKG1
YKR100C
1068 nt
6.95
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
TAE1
YBR261C
699 nt
6.95
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
ERG12
YMR208W
1332 nt
6.95
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
MSC3
YLR219W
2187 nt
6.94
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
YJL107C
YJL107C
1164 nt
6.94
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
SNF7
YLR025W
723 nt
6.94
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
YNL097W-A
YNL097W-A
156 nt
6.94
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
RPS28A
YOR167C
204 nt
6.94
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
UIP4
YPL186C
915 nt
6.94
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
YAH1
YPL252C
519 nt
6.94
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
ICP55
YER078C
1536 nt
6.93
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
YLL056C
YLL056C
897 nt
6.93
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
YLR157W-E
YLR157W-E
165 nt
6.93
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
YNR068C
YNR068C
819 nt
6.93
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
SMK1
YPR054W
1167 nt
6.93
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
NUP57
YGR119C
1626 nt
6.92
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
VMA3
YEL027W
483 nt
6.92
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
YKL102C
YKL102C
306 nt
6.92
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
YKR045C
YKR045C
552 nt
6.92
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
YBR027C
YBR027C
333 nt
6.92
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
YOR300W
YOR300W
309 nt
6.92
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
PEX3
YDR329C
1326 nt
6.92
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
AFG3
YER017C
2286 nt
6.92
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
CUP2
YGL166W
678 nt
6.91
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
MRS3
YJL133W
945 nt
6.91
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
YLR112W
YLR112W
420 nt
6.91
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
SLD7
YOR060C
774 nt
6.91
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
NAT5
YOR253W
531 nt
6.91
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
PET20
YPL159C
762 nt
6.91
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
ERG24
YNL280C
1317 nt
6.91
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
CIT3
YPR001W
1461 nt
6.91
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
ZWF1
YNL241C
1518 nt
6.91
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
EXG2
YDR261C
1689 nt
6.9
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
MHT1
YLL062C
975 nt
6.9
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
CWC25
YNL245C
540 nt
6.9
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
RTC2
YBR147W
891 nt
6.9
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
LYS21
YDL131W
1323 nt
6.9
□□□□□ -1.3
SGO1
Q08490
CLN1
YMR199W
1641 nt
6.9
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
RDR1
YOR380W
1641 nt
6.9
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
NMD5
YJR132W
3147 nt
6.9
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
YGL102C
YGL102C
429 nt
6.89
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
YPR150W
YPR150W
522 nt
6.89
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
ATG23
YLR431C
1362 nt
6.89
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
EMP65
YER140W
1671 nt
6.89
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
ICE2
YIL090W
1476 nt
6.88
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
RSM23
YGL129C
1353 nt
6.88
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
PIC2
YER053C
903 nt
6.88
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
YGL118C
YGL118C
438 nt
6.88
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
YGL260W
YGL260W
231 nt
6.88
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
ERG27
YLR100W
1044 nt
6.88
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
CUE4
YML101C
354 nt
6.88
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
MRPL10
YNL284C
969 nt
6.88
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
COA2
YPL189C-A
207 nt
6.88
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
PRI1
YIR008C
1230 nt
6.87
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
ZRT2
YLR130C
1269 nt
6.87
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
OST3
YOR085W
1053 nt
6.87
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
ASN2
YGR124W
1719 nt
6.87
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
NTG1
YAL015C
1200 nt
6.86
□□□□□ -1.31
SGO1
Q08490
LIP5
YOR196C
1245 nt
6.86
□□□□□ -1.31
First
Previous
13
Next
Last
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.3 ms