Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tff1Q08423 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tff1Q08423 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff1Q08423 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms