Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACNB2Q08289 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACNB2Q08289 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACNB2Q08289 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACNB2Q08289 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACNB2Q08289 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNB2Q08289 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNB2Q08289 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNB2Q08289 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNB2Q08289 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNB2Q08289 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNB2Q08289 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNB2Q08289 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNB2Q08289 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNB2Q08289 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNB2Q08289 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CACNB2Q08289 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CACNB2Q08289 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNB2Q08289 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNB2Q08289 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms