Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACTN3Q08043 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN3Q08043 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN3Q08043 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN3Q08043 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms