Protein–RNA interactions for Protein: Q07283

TCHH, Trichohyalin, humanhuman

Predictions only

Length 1,943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCHHQ07283 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TCHHQ07283 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TCHHQ07283 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCHHQ07283 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCHHQ07283 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCHHQ07283 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TCHHQ07283 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCHHQ07283 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCHHQ07283 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TCHHQ07283 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCHHQ07283 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TCHHQ07283 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCHHQ07283 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCHHQ07283 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCHHQ07283 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCHHQ07283 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCHHQ07283 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCHHQ07283 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCHHQ07283 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TCHHQ07283 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TCHHQ07283 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TCHHQ07283 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCHHQ07283 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TCHHQ07283 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TCHHQ07283 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCHHQ07283 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCHHQ07283 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCHHQ07283 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TCHHQ07283 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCHHQ07283 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCHHQ07283 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCHHQ07283 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCHHQ07283 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCHHQ07283 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCHHQ07283 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TCHHQ07283 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCHHQ07283 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCHHQ07283 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCHHQ07283 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCHHQ07283 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCHHQ07283 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TCHHQ07283 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TCHHQ07283 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TCHHQ07283 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TCHHQ07283 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms