Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Caprin2Q05A80 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Caprin2Q05A80 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Caprin2Q05A80 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Caprin2Q05A80 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms