Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r236Q05A06 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vmn1r236Q05A06 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r236Q05A06 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r236Q05A06 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r236Q05A06 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r236Q05A06 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r236Q05A06 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r236Q05A06 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r236Q05A06 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r236Q05A06 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r236Q05A06 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r236Q05A06 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r236Q05A06 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r236Q05A06 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r236Q05A06 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r236Q05A06 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r236Q05A06 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r236Q05A06 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r236Q05A06 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms