Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC18A2Q05940 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC18A2Q05940 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC18A2Q05940 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms