Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGR4Q05215 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGR4Q05215 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EGR4Q05215 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGR4Q05215 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGR4Q05215 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EGR4Q05215 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EGR4Q05215 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGR4Q05215 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGR4Q05215 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms