Protein–RNA interactions for Protein: Q04749

AVO2, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO2, yeastyeast

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO2Q04749 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.5□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.5□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.5□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.5□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.5□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.5□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.5□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.5□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.5□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.5□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 MOD5YOR274W 1287 nt5.5□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 YPR130CYPR130C 408 nt5.5□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 HXK2YGL253W 1461 nt5.5□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 YDR387CYDR387C 1668 nt5.5□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 AFG1YEL052W 1530 nt5.49□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 DAL4YIR028W 1908 nt5.49□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 PTC7YHR076W 1032 nt5.49□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 FUS3YBL016W 1062 nt5.49□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 GET4YOR164C 939 nt5.49□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 YMR034CYMR034C 1305 nt5.48□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 HAS1YMR290C 1518 nt5.48□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 MRPS28YDR337W 861 nt5.48□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 YML133CYML133C 4125 nt5.48□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 DML1YMR211W 1428 nt5.48□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 FBA1YKL060C 1080 nt5.47□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 STT3YGL022W 2157 nt5.47□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 YHR020WYHR020W 2067 nt5.47□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 STB5YHR178W 2232 nt5.47□□□□□ -1.53
AVO2Q04749 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt5.46□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 YNR005CYNR005C 405 nt5.46□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 YBR113WYBR113W 483 nt5.46□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 FRE5YOR384W 2085 nt5.45□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 YLR358CYLR358C 564 nt5.45□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 RPS28AYOR167C 204 nt5.45□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 YDR306CYDR306C 1437 nt5.45□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 PFK2YMR205C 2880 nt5.45□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 PYK2YOR347C 1521 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 MRC1YCL061C 3291 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 MTC5YDR128W 3447 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 CIA1YDR267C 993 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 HEM2YGL040C 1029 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 RPP1YHR062C 882 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 YIA6YIL006W 1122 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 CCP1YKR066C 1086 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 ICT1YLR099C 1185 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 YNL092WYNL092W 1203 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 HTZ1YOL012C 405 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 PXL1YKR090W 2121 nt5.44□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 EDE1YBL047C 4146 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 THI2YBR240C 1353 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 PDA1YER178W 1263 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 DFR1YOR236W 636 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 PET494YNR045W 1470 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 PPM2YOL141W 2088 nt5.43□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 VPS61YDR136C 573 nt5.42□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 MIA40YKL195W 1212 nt5.42□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 YPQ1YOL092W 927 nt5.42□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 SMX3YPR182W 261 nt5.42□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 APE4YHR113W 1473 nt5.41□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 PRY3YJL078C 2646 nt5.41□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 PAU21YOR394W 495 nt5.41□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 SEC62YPL094C 825 nt5.41□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 PAU22YPL282C 495 nt5.41□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 MRPL1YDR116C 858 nt5.4□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 YGL102CYGL102C 429 nt5.4□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 PRI1YIR008C 1230 nt5.4□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 SQT1YIR012W 1296 nt5.4□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 ATG36YJL185C 882 nt5.4□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 YLR123CYLR123C 330 nt5.4□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 YPL067CYPL067C 597 nt5.4□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 YCL049CYCL049C 939 nt5.4□□□□□ -1.54
AVO2Q04749 CCC2YDR270W 3015 nt5.4□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 SLX5YDL013W 1860 nt5.4□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 IVY1YDR229W 1362 nt5.4□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 MSY1YPL097W 1479 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 ALT2YDR111C 1524 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 HED1YDR014W-A 489 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 DMA1YHR115C 1251 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 YLR312CYLR312C 1197 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 ARA2YMR041C 1008 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 TMA46YOR091W 1038 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 snR30snR30 606 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 UME1YPL139C 1383 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 COQ1YBR003W 1422 nt5.39□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 BZZ1YHR114W 1902 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 VPS5YOR069W 2028 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 PIH1YHR034C 1035 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 YNL120CYNL120C 486 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 CLB2YPR119W 1476 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 ICP55YER078C 1536 nt5.38□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 FET4YMR319C 1659 nt5.37□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 MRPS12YNR036C 462 nt5.37□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt5.37□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 DAL7YIR031C 1665 nt5.37□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 PUS7YOR243C 2031 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 TRR2YHR106W 1029 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 MBF1YOR298C-A 456 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 ERG10YPL028W 1197 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 DOT1YDR440W 1749 nt5.36□□□□□ -1.55
AVO2Q04749 MSC3YLR219W 2187 nt5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56.7 ms