Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
EMX1Q04741 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMX1Q04741 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMX1Q04741 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms