Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT17Q04695 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KRT17Q04695 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRT17Q04695 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT17Q04695 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms