Protein–RNA interactions for Protein: Q03702

CCE1, Cruciform cutting endonuclease 1, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCE1Q03702 SCS7YMR272C 1155 nt6.46□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 RUF23RUF23 254 nt6.46□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 COQ1YBR003W 1422 nt6.46□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 CBK1YNL161W 2271 nt6.46□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 ERS1YCR075C 783 nt6.45□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 PAC10YGR078C 600 nt6.45□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 RFC4YOL094C 972 nt6.45□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 MDH1YKL085W 1005 nt6.44□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 MRPL23YOR150W 492 nt6.44□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 HBN1YCL026C-B 582 nt6.44□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 YBR241CYBR241C 1467 nt6.43□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 KSH1YNL024C-A 219 nt6.43□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 YPL041CYPL041C 624 nt6.43□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 GCN3YKR026C 918 nt6.42□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 UIP5YKR044W 1332 nt6.42□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 TAH11YJR046W 1815 nt6.41□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 ZWF1YNL241C 1518 nt6.41□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 YCR061WYCR061W 1896 nt6.41□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 VMA3YEL027W 483 nt6.41□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 MGM101YJR144W 810 nt6.41□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 YBR027CYBR027C 333 nt6.41□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 OPI11YPR044C 354 nt6.41□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 FAL1YDR021W 1200 nt6.4□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 LYS1YIR034C 1122 nt6.4□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt6.4□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 YMR122CYMR122C 375 nt6.4□□□□□ -1.38
CCE1Q03702 CMK2YOL016C 1344 nt6.4□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 OSW2YLR054C 2175 nt6.4□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 CYB2YML054C 1776 nt6.39□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt6.39□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 YJR146WYJR146W 354 nt6.39□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 DRE2YKR071C 1047 nt6.39□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 TSR2YLR435W 618 nt6.39□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 YBL112CYBL112C 318 nt6.39□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 IRC11YOR013W 471 nt6.39□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 CTF19YPL018W 1110 nt6.39□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 EDE1YBL047C 4146 nt6.39□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 CIR2YOR356W 1896 nt6.39□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.38□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.38□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.38□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.38□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.38□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.38□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.38□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.38□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.38□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.38□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.38□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.38□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.38□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.38□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.38□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.38□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 YMR252CYMR252C 405 nt6.38□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 NMD5YJR132W 3147 nt6.38□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 CCT8YJL008C 1707 nt6.37□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 TDH2YJR009C 999 nt6.37□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.37□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 YPL257WYPL257W 582 nt6.37□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 RGD2YFL047W 2145 nt6.37□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 DAL7YIR031C 1665 nt6.36□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 CUP2YGL166W 678 nt6.36□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 COX16YJL003W 357 nt6.36□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 MIA40YKL195W 1212 nt6.36□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 YKR045CYKR045C 552 nt6.36□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 ACO1YLR304C 2337 nt6.35□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 FYV1YDR024W 486 nt6.35□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 HHY1YEL059W 309 nt6.35□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.35□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 OGG1YML060W 1131 nt6.35□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 TAE1YBR261C 699 nt6.35□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 STT3YGL022W 2157 nt6.35□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 RRP9YPR137W 1722 nt6.34□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 GPD2YOL059W 1323 nt6.34□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 PPH22YDL188C 1134 nt6.34□□□□□ -1.39
CCE1Q03702 YDR187CYDR187C 519 nt6.33□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 YDR415CYDR415C 1125 nt6.33□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 SPG1YGR236C 288 nt6.33□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 YKR032WYKR032W 315 nt6.33□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 RNH201YNL072W 924 nt6.33□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 CDC1YDR182W 1476 nt6.33□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 ICL2YPR006C 1728 nt6.33□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 NUP84YDL116W 2181 nt6.33□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 NTG1YAL015C 1200 nt6.32□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 YNR014WYNR014W 639 nt6.32□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 PPS1YBR276C 2424 nt6.32□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 ASN2YGR124W 1719 nt6.32□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 YMR279CYMR279C 1623 nt6.32□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 PEX3YDR329C 1326 nt6.31□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 YPT1YFL038C 621 nt6.31□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 IMD1YAR073W 1212 nt6.31□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 DFR1YOR236W 636 nt6.31□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 YOS9YDR057W 1629 nt6.31□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 CCT3YJL014W 1605 nt6.31□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 EDC3YEL015W 1656 nt6.3□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 MSO1YNR049C 633 nt6.3□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 LDB16YCL005W 771 nt6.29□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 PEX31YGR004W 1389 nt6.29□□□□□ -1.4
CCE1Q03702 YOR389WYOR389W 1875 nt6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 246.6 ms