Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TAP1Q03518 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TAP1Q03518 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TAP1Q03518 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAP1Q03518 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms