Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tff2Q03404 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tff2Q03404 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tff2Q03404 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tff2Q03404 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tff2Q03404 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tff2Q03404 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tff2Q03404 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tff2Q03404 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tff2Q03404 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tff2Q03404 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tff2Q03404 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tff2Q03404 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tff2Q03404 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tff2Q03404 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tff2Q03404 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tff2Q03404 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tff2Q03404 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tff2Q03404 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tff2Q03404 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tff2Q03404 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tff2Q03404 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tff2Q03404 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tff2Q03404 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tff2Q03404 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms