Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddr1Q03146 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddr1Q03146 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddr1Q03146 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddr1Q03146 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms