Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLOD1Q02809 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLOD1Q02809 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLOD1Q02809 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLOD1Q02809 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms