Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL18AQ02543 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPL18AQ02543 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL18AQ02543 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL18AQ02543 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL18AQ02543 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RPL18AQ02543 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RPL18AQ02543 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms