Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH6A1Q02252 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH6A1Q02252 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH6A1Q02252 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH6A1Q02252 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALDH6A1Q02252 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALDH6A1Q02252 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALDH6A1Q02252 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALDH6A1Q02252 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALDH6A1Q02252 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH6A1Q02252 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH6A1Q02252 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH6A1Q02252 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH6A1Q02252 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH6A1Q02252 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH6A1Q02252 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH6A1Q02252 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH6A1Q02252 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH6A1Q02252 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH6A1Q02252 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH6A1Q02252 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH6A1Q02252 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH6A1Q02252 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH6A1Q02252 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH6A1Q02252 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH6A1Q02252 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.8 ms