Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnnb1Q02248 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ctnnb1Q02248 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ctnnb1Q02248 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ctnnb1Q02248 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms