Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ascl1Q02067 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ascl1Q02067 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ascl1Q02067 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl1Q02067 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms