Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gbp1Q01514 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gbp1Q01514 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gbp1Q01514 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gbp1Q01514 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gbp1Q01514 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbp1Q01514 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gbp1Q01514 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms