Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Top2aQ01320 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Top2aQ01320 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Top2aQ01320 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Top2aQ01320 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Top2aQ01320 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Top2aQ01320 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Top2aQ01320 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Top2aQ01320 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Top2aQ01320 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Top2aQ01320 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Top2aQ01320 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Top2aQ01320 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Top2aQ01320 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Top2aQ01320 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Top2aQ01320 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
Top2aQ01320 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Top2aQ01320 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Top2aQ01320 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Top2aQ01320 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Top2aQ01320 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Top2aQ01320 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Top2aQ01320 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Top2aQ01320 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Top2aQ01320 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Top2aQ01320 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Top2aQ01320 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Top2aQ01320 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Top2aQ01320 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Top2aQ01320 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Top2aQ01320 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Top2aQ01320 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Top2aQ01320 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Top2aQ01320 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Top2aQ01320 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Top2aQ01320 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Top2aQ01320 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Top2aQ01320 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Top2aQ01320 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Top2aQ01320 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Top2aQ01320 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Top2aQ01320 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Top2aQ01320 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Top2aQ01320 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Top2aQ01320 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Top2aQ01320 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Top2aQ01320 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Top2aQ01320 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Top2aQ01320 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Top2aQ01320 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Top2aQ01320 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Top2aQ01320 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Top2aQ01320 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Top2aQ01320 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Top2aQ01320 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Top2aQ01320 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Top2aQ01320 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Top2aQ01320 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Top2aQ01320 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Top2aQ01320 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Top2aQ01320 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Top2aQ01320 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Top2aQ01320 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Top2aQ01320 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Top2aQ01320 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Top2aQ01320 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Top2aQ01320 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Top2aQ01320 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Top2aQ01320 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Top2aQ01320 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Top2aQ01320 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Top2aQ01320 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms