Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Grin2bQ01097 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Grin2bQ01097 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Grin2bQ01097 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Grin2bQ01097 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Grin2bQ01097 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Grin2bQ01097 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Grin2bQ01097 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Grin2bQ01097 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Grin2bQ01097 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Grin2bQ01097 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Grin2bQ01097 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Grin2bQ01097 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Grin2bQ01097 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Grin2bQ01097 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Grin2bQ01097 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Grin2bQ01097 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Grin2bQ01097 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Grin2bQ01097 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Grin2bQ01097 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Grin2bQ01097 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Grin2bQ01097 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Grin2bQ01097 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Grin2bQ01097 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Grin2bQ01097 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Grin2bQ01097 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Grin2bQ01097 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Grin2bQ01097 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Grin2bQ01097 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Grin2bQ01097 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Grin2bQ01097 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Grin2bQ01097 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Grin2bQ01097 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Grin2bQ01097 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Grin2bQ01097 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Grin2bQ01097 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Grin2bQ01097 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Grin2bQ01097 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Grin2bQ01097 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Grin2bQ01097 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Grin2bQ01097 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Grin2bQ01097 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Grin2bQ01097 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Grin2bQ01097 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Grin2bQ01097 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Grin2bQ01097 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Grin2bQ01097 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Grin2bQ01097 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Grin2bQ01097 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Grin2bQ01097 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Grin2bQ01097 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Grin2bQ01097 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Grin2bQ01097 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Grin2bQ01097 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Grin2bQ01097 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Grin2bQ01097 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Grin2bQ01097 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Grin2bQ01097 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Grin2bQ01097 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Grin2bQ01097 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Grin2bQ01097 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Grin2bQ01097 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Grin2bQ01097 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Grin2bQ01097 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Grin2bQ01097 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.46
Grin2bQ01097 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Grin2bQ01097 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Grin2bQ01097 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Grin2bQ01097 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Grin2bQ01097 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Grin2bQ01097 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Grin2bQ01097 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Grin2bQ01097 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Grin2bQ01097 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.5 ms