Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apoa1Q00623 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apoa1Q00623 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apoa1Q00623 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Apoa1Q00623 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms