Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CLTCQ00610 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CLTCQ00610 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CLTCQ00610 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CLTCQ00610 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CLTCQ00610 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CLTCQ00610 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CLTCQ00610 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CLTCQ00610 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CLTCQ00610 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CLTCQ00610 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CLTCQ00610 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CLTCQ00610 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CLTCQ00610 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CLTCQ00610 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CLTCQ00610 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CLTCQ00610 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CLTCQ00610 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
CLTCQ00610 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLTCQ00610 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLTCQ00610 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLTCQ00610 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLTCQ00610 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CLTCQ00610 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CLTCQ00610 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
CLTCQ00610 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CLTCQ00610 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CLTCQ00610 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CLTCQ00610 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CLTCQ00610 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CLTCQ00610 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CLTCQ00610 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CLTCQ00610 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CLTCQ00610 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
CLTCQ00610 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CLTCQ00610 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CLTCQ00610 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CLTCQ00610 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
CLTCQ00610 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLTCQ00610 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLTCQ00610 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLTCQ00610 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLTCQ00610 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CLTCQ00610 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CLTCQ00610 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
CLTCQ00610 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CLTCQ00610 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CLTCQ00610 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CLTCQ00610 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CLTCQ00610 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
CLTCQ00610 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
CLTCQ00610 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.42
CLTCQ00610 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CLTCQ00610 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
CLTCQ00610 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CLTCQ00610 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CLTCQ00610 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CLTCQ00610 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CLTCQ00610 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CLTCQ00610 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CLTCQ00610 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CLTCQ00610 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CLTCQ00610 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CLTCQ00610 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CLTCQ00610 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CLTCQ00610 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CLTCQ00610 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CLTCQ00610 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CLTCQ00610 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CLTCQ00610 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CLTCQ00610 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
CLTCQ00610 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CLTCQ00610 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CLTCQ00610 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CLTCQ00610 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CLTCQ00610 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CLTCQ00610 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CLTCQ00610 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms