Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK16Q00536 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK16Q00536 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK16Q00536 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms