Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TFAMQ00059 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TFAMQ00059 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TFAMQ00059 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TFAMQ00059 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms